Ministerul Afacerilor Externe deţine un important fond de documente diplomatice (peste 8000 m. liniari) create de administraţia centrală, misiunile diplomatice şi oficiile consulare ale României în străinătate. In principal, documentele sunt clasate în funcţie de originea lor.

Cele mai importante fonduri istorice ale Arhivelor Diplomatice româneşti sunt:

• Fondul Arhiva Istorică (1831-1895)
• Fondul Razboiul de Independenţă (1877-1878)
• Fondul Arhiva politico-diplomatică (1920-1944), organizat alfabetic, pe ţări
• Fondul Mica Inţelegere
• Fondul Inţelegerea Balcanică
• Fondul Conferinţa de Pace de la Paris (1946-1947)
• Fondul Geneva - Societatea Naţiunilor
• Fondul 71/ 1920-1944. Arhiva politico-diplomatică, organizat alfabetic, pe ţări
• Fondul 71/ 1920-1944. Transilvania

In cadrul fondurilor propriu-zise, dosarele sunt organizate pe probleme (de la 1-105), aşa cum au fost ele clasificate în Nomenclatorul de arhivă întocmit în 1909, după modelul austriac. Marea majoritate a fondurilor sunt şi astăzi inventariate şi clasificate conform acestui sistem.

Printre principalele probleme menţionăm:

• Problema 15 - Şcoli şi biserici româneşti în străinătate
• Problema 16 - Şcoli şi biserici străine în România
• Problema 21 - 1878-1913 – Rapoarte politice de la reprezentanţele diplomatice ale României în străinătate
• Problema 33 - Problema evreiască
• Problema 41 - Comerţul exterior al României
• Problema 71 - Evenimente politice, clasificată în mai multe subdiviziuni, cele mai importante fiind:
  - 71/1914 (E1 si E2): Primul Război mondial (1914-1918) şi Conferinţa de pace de la Paris (1919-1920)
  - 71/1939 (E9) - Al Doilea război mondial (1939-1947)
  - 71/1920-1944 - Dosare Speciale, clasificate şi ele pe probleme interne şi relaţii internaţionale (exemple: Căsătorii între monarhi; Decese monarhi; Războaiele balcanice; Românii din Balcani; Războiul civil din Spania; Rebeliunea legionară; Restaurarea habsburgilor; Anschluss etc.)
• Problema 75 (1875-1944) - grupează consulii onorifici, pe ţări;
• Problema 77 (1920-1944) - cuprinde dosarele personale ale foştilor funcţionari ai M.A.E.  Potrivit dispozitiilor Legii nr. 16 din 1996, Legea Arhivelor Naţionale, termenul după care pot fi date spre studiu aceste dosare este 75 de ani de la data crearii lor.
• Problema 82 (1875-1947) - se referă la organizarea Ministerului Afacerilor Străine. Sunt inventariate şi clasificate documente din această perioadă cu referire la organizarea Ministerului Afacerilor Străine.